Protein–RNA interactions for Protein: O35857

Timm44, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM44, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timm44O35857 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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Timm44O35857 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Timm44O35857 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms