Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Cited2O35740 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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Cited2O35740 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
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Cited2O35740 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Cited2O35740 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Cited2O35740 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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