Protein–RNA interactions for Protein: O35652

Lhx8, LIM/homeobox protein Lhx8, mousemouse

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Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx8O35652 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm4806-201ENSMUST00000222704 1690 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm14743-201ENSMUST00000114026 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm2861-201ENSMUST00000199885 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Olfr202-202ENSMUST00000201687 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 4930595O18Rik-201ENSMUST00000205099 607 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 AC161426.1-201ENSMUST00000214137 286 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Fancd2os-201ENSMUST00000035870 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Celrr-201ENSMUST00000181183 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm28541-201ENSMUST00000185206 442 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 4930540E01Rik-201ENSMUST00000192569 1146 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm4224-201ENSMUST00000211557 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Lhx8O35652 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Mir124-2hg-204ENSMUST00000188983 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Klra5-202ENSMUST00000118060 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm13339-201ENSMUST00000120651 510 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Klra5-201ENSMUST00000014683 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm20614-201ENSMUST00000177106 632 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm37337-201ENSMUST00000192601 993 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Lhx8O35652 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms