Protein–RNA interactions for Protein: O35646

Capn6, Calpain-6, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn6O35646 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Capn6O35646 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Capn6O35646 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms