Protein–RNA interactions for Protein: O35345

Kpna6, Importin subunit alpha-7, mousemouse

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Length 536 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna6O35345 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Kpna6O35345 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kpna6O35345 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kpna6O35345 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kpna6O35345 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kpna6O35345 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
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Kpna6O35345 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Kpna6O35345 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms