Protein–RNA interactions for Protein: O35239

Ptpn9, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 9, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn9O35239 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ptpn9O35239 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms