Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Casq1O09165 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Casq1O09165 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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