Protein–RNA interactions for Protein: O09000

Ncoa3, Nuclear receptor coactivator 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncoa3O09000 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ncoa3O09000 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ncoa3O09000 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms