Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm3542K7N6U2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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