Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm3415J3QMS8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm3415J3QMS8 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
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