Protein–RNA interactions for Protein: J3KMI7

Gm20828, MCG116667, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20828J3KMI7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm20828J3KMI7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm20828J3KMI7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm20828J3KMI7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm20828J3KMI7 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm20828J3KMI7 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm20828J3KMI7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm20828J3KMI7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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