Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X2

Pabpc4l, MCG12357, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc4lG5E8X2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pabpc4lG5E8X2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms