Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Slc9a3G3X939 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms