Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Gm28038F7BCN9 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms