Protein–RNA interactions for Protein: F6YKY3

Gm8005, Predicted gene 8005 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8005F6YKY3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8005F6YKY3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8005F6YKY3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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