Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Gm10378F6XQQ1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm10378F6XQQ1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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