Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Crocc2F6XLV1 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Crocc2F6XLV1 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms