Protein–RNA interactions for Protein: F6VRN1

Smgc, Submandibular gland protein C (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SmgcF6VRN1 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SmgcF6VRN1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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