Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Gm8247F6VRJ8 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Gm8247F6VRJ8 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms