Protein–RNA interactions for Protein: F6TQD1

Rnf212, Probable E3 SUMO-protein ligase RNF212, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf212F6TQD1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Rnf212F6TQD1 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms