Protein–RNA interactions for Protein: E9Q658

Pate1, Prostate and testis-expressed 1, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Pate1E9Q658 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Pate1E9Q658 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pate1E9Q658 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Pate1E9Q658 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pate1E9Q658 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pate1E9Q658 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pate1E9Q658 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pate1E9Q658 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pate1E9Q658 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Pate1E9Q658 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Pate1E9Q658 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms