Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Zfp558E9Q1J0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Zfp558E9Q1J0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Zfp558E9Q1J0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Zfp558E9Q1J0 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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