Protein–RNA interactions for Protein: E9Q035

Gm20425, Predicted gene 20425, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 978 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20425E9Q035 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Gm20425E9Q035 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm20425E9Q035 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms