Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rsph10bE9PYQ0 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms