Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Trappc8E9PWG2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Akirin1-ps-201ENSMUST00000119676 458 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Trappc8E9PWG2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms