Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Clca3bE9PUL3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Clca3bE9PUL3 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms