Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
BC035044E0CXF8 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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