Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
Vpreb3D3Z6J4 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Vpreb3D3Z6J4 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms