Protein–RNA interactions for Protein: C0HKC9

Smok3b, Sperm motility kinase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smok3bC0HKC9 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Smok3bC0HKC9 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Smok3bC0HKC9 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms