Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Phf11bB4XVQ1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Phf11bB4XVQ1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
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Phf11bB4XVQ1 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Phf11bB4XVQ1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
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Phf11bB4XVQ1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Phf11bB4XVQ1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Phf11bB4XVQ1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Phf11bB4XVQ1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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