Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6133B2RY53 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6133B2RY53 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.9 ms