Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Usf3B2RUQ2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Usf3B2RUQ2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms