Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Vamp8-202ENSMUST00000142613 2076 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Tmem238A9JSM3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms