Protein–RNA interactions for Protein: A7XV07

Skint8, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint8A7XV07 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Skint8A7XV07 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms