Protein–RNA interactions for Protein: A7TZF3

Skint4, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint4A7TZF3 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Skint4A7TZF3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Skint4A7TZF3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms