Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Cldn34dA2AGU5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
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