Protein–RNA interactions for Protein: A2A6H3

Fbxo47, F-box only protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo47A2A6H3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Fbxo47A2A6H3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fbxo47A2A6H3 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms