Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP2

Vmn2r25, MCG130582, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r25W4VSP2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn2r25W4VSP2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn2r25W4VSP2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms