Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Vstm4T1NXB5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vstm4T1NXB5 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms