Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Top3bQ9Z321 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Top3bQ9Z321 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms