Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q5

Mrpl40, 39S ribosomal protein L40, mitochondrial, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl40Q9Z2Q5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Mrpl40Q9Z2Q5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Mrpl40Q9Z2Q5 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mrpl40Q9Z2Q5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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