Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ubl3Q9Z2M6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
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Ubl3Q9Z2M6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Ubl3Q9Z2M6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
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