Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdpk1Q9Z2A0 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdpk1Q9Z2A0 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdpk1Q9Z2A0 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Pdpk1Q9Z2A0 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Pdpk1Q9Z2A0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Pdpk1Q9Z2A0 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Pdpk1Q9Z2A0 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Pdpk1Q9Z2A0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Pdpk1Q9Z2A0 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
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Pdpk1Q9Z2A0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
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Pdpk1Q9Z2A0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Pdpk1Q9Z2A0 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Pdpk1Q9Z2A0 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Pdpk1Q9Z2A0 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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