Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z184

Padi3, Protein-arginine deiminase type-3, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Padi3Q9Z184 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Padi3Q9Z184 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms