Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Shcbp1Q9Z179 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms