Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S5

Cldn15, Claudin-15, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn15Q9Z0S5 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn15Q9Z0S5 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn15Q9Z0S5 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms