Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVP6

Papolb, Poly(A) polymerase beta, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PapolbQ9WVP6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PapolbQ9WVP6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PapolbQ9WVP6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms