Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVE8

Pacsin2, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin2Q9WVE8 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pacsin2Q9WVE8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pacsin2Q9WVE8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms