Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Clcn5Q9WVD4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms