Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Scnn1bQ9WU38 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Scnn1bQ9WU38 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms